1. BMKMANU S3000-ATAC测序数据质量优异
ATAC数据TSS富集及Fragment分布表现优异,降维聚类结果揭示清晰的空间表观遗传分区。

图2. TSS富集图及Fragment分布图

图3. 百创S3000-ATAC降维聚类结果
2. BMKMANU S3000-ATAC+mRNA联合分析
通过将ATAC-seq与相邻空间转录组切片进行高精度图像对齐,联合降维聚类、桑基图及热图分析证实,染色质可及性与基因表达模式在空间单细胞分辨率上高度协同,聚类结果吻合度优异。
图4. 联合降维聚类结果
图5. 桑基图及聚类细胞共享热图
3. BMKMANU S3000-ATAC+S3000-mRNA调控表达逻辑
通过整合染色质可及性、转录因子结合motif、基因活性预测及实际mRNA表达数据,可系统构建“染色质开放→调控元件识别→基因潜能预测→表达水平验证”的完整空间多组学调控逻辑链。
图6. 整合染色质可及性与基因表达空间调控逻辑链
本次测试验证了新葡的京生物SURFSeq 5000高通量测序平台与百创智造BMKMANU S3000-ATAC组合应用的优秀性能,二者协同实现了从高质量测序数据到高分辨率空间表观遗传分析的完整闭环。
整合空间ATAC与空间转录组分析,全面展示了空间多组学在解析生命过程复杂调控网络的强大能力,能够将染色质可及性、转录因子调控、基因活性及基因表达水平等多层级信息进行耦合,为生命科学前沿研究提供了有力工具。新葡的京生物期待与行业伙伴共建基因测序平台应用生态联盟,依托各方优势,共同为用户提供从测序到多组学洞察的全流程、一体化解决方案。